Was macht ein Bioinformatiker?

Tätigkeit eines Bioinformatikers

Als Bioinformatiker ist Dein Hauptaufgabenfeld, das Verarbeiten von Daten im Hinblick auf biologischen Strukturen und Prozessen. Unterstützt wirst Du dabei von neusten Informationstechnologien. Als Bioinformatiker agierst Du im interdisziplinären Rahmen und bist an der Schnittstelle zwischen der Informatik und den so bezeichneten Life Sciences (Chemie, Biologie sowie Pharmazie) tätig. So löst Du also Probleme, die sich innerhalb der Lebenswissenschaften ergeben, mit computergestützten Methoden. In der Öffentlichkeit bekannt geworden ist die Arbeit von Bioinformatikern erst richtig im Jahr 2001, als Bioinformatiker im Hinblick auf die Sequenzierung des menschlichen Genoms entscheidende Hinweise gaben. Grundsätzlich gilt die Bioinformatik als ein Forschungsgebiet mit einem ungemein breiten Spektrum. Wesentliche Segmente der Bioinformatik sind diesbezüglich zum Beispiel die Integration und Verwaltung biologischer Daten, die Strukturbioinformatik, die Sequenzanalyse und die Datenanalyse in Bezug auf Hochdurchsatzmethoden. Da die Bioinformatik grundsätzlich benötigt wird, um Datenmaterial in großem Maßstab zu bewerten respektive zu analysieren, bist Du mit Deiner Tätigkeit als Bioinformatiker gerade wichtig für die Systembiologie. Durch die kontinuierlich stark wachsende Menge an biologischen Informationen bzw. Daten (Beispiel: DNA- und Proteinsequenzen und ihre Annotation, Interaktionen biologischer Moleküle, 3D-Proteinstrukturen sowie Hochdurchsatzdaten von zum Beispiel Microarrays) steigen die Anforderungen an die explizite Handhabung eben dieser Daten stetig an. Als Bioinformatiker kümmerst Du Dich dabei vorzugsweise um eine entsprechende Datenaufbereitung sowie Datensicherung in verknüpften und geeignet indizierten biologischen Datenbanken.

Folgende Aufgaben innerhalb unterschiedlicher Anwendungsbereiche zählen dabei generell zu Deinem Portfolio:

• Du musst als Bioinformatiker für die Datenverwaltung effektive und computergestützte Verarbeitungsmethoden generieren bzw. nutzen.
• Die Erstellung von verlinkten und geeignet indizierten biologischen Datenbanken ist dabei eine Deiner Haupttätigkeiten.
• Nutzen und Optimieren der so bezeichneten Protein Data Bank. In dieser am längsten existierenden Datenbank sind überaus viele Daten über die Aminosäuresequenz und 3D-Strukturen von Makromolekülen (biologisch wichtig) gespeichert.
• Nutzen und Optimieren der verschiedenen Nukleotidfrequenz-Datenbanken, die sich zur Gemeinschaftsarbeit unter dem Dach der Internationalen Nukleotidsequenz-Datenbank-Zusammenarbeit symbiotisch vereinigt haben.
• Durchführen einer Sequenzanalyse. Diesbezüglich testest Du als Bioinformatiker, ob bei einem entsprechenden Sequenzvergleich zwei Gene zusammen passen bzw. miteinander verwandt sind. Hierbei setzt Du als Bioinformatiker auf eine dynamische Programmierung mit entsprechenden Algorithmen sowie auf die so bezeichneten heuristische Algorithmen.
• Des Weiteren führst Du Analysen von Genomen durch. Dabei fügst Du DNA-Bruchstücke mit Unterstützung von bestimmten bioinformatischen Anwendungen zusammen.
• Du wählst Methoden bzw. Instrumente zum Auffinden von Genen aus. Deine bevorzugten Einsatzgebiete sind diesbezüglich vor allem die unbekannten DNA-Sequenzen wie zum Beispiel die Markow-Ketten, die statistische Sequenzanalyse oder auch künstliche neuronale Netze, die der Mustererkennung dienen.
• Auch die Strukturbioinformatik nimmt einen breiten Raum innerhalb Deines Aufgabenportfolios ein. Du bearbeitest dabei vor allem die entsprechenden Fragestellungen der Proteomik, wobei die Bereiche Proteinstruktur, Strukturanalyse sowie Proteinfaltung Priorität genießen.
• Als Bioinformatiker bist Du für die Analyse der Sekundär- und auch der Tertiärstruktur verantwortlich; Voraussetzung für eine Analyse dieser Art ist allerdings das Kennen der Aminosäuresequenz.
• Du untersuchst mit diversen Liganden die jeweilige Interaktion von Proteinen. - Auch die exakte Erforschung respektive Analyse des Verhaltens von mutierten Proteinen zählt zu Deinem Aufgabengebiet als Bioinformatiker. Einen hohen Stellenwert besitzt dabei Deine Einschätzung, welche Auswirkungen bzw. Folgen ein verändertes Makromolekül im Endeffekt auf die Funktionen und die Funktionsweisen des menschlichen Körpers hat.